MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785L

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013505	ACT	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013505	AGA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013505	CAT	2	6	141	146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013505	CTAA	2	8	226	233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013505	ATC	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013505	TGAA	2	8	350	357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013505	ATTATG	2	12	380	391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013505	ATT	2	6	394	399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013505	GCT	2	6	433	438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013505	ACA	3	9	477	485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013505	AT	3	6	516	521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013505	GCA	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013505	TAG	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013505	AGA	3	9	633	641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013505	ATA	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013505	TCA	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013505	ATG	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013505	GTA	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013505	TATT	2	8	1199	1206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013505	T	6	6	1235	1240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013505	TAG	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013505	TAAAT	2	10	1336	1345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013505	AG	3	6	1364	1369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013505	AAG	2	6	2012	2017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013505	CTT	2	6	2040	2045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013505	T	6	6	2052	2057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013505	AAT	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013505	ATTT	2	8	2119	2126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013505	T	7	7	2124	2130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013505	TA	4	8	2177	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013505	TA	3	6	2250	2255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013505	TTA	2	6	2351	2356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013505	TAA	2	6	2455	2460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013505	TA	4	8	2507	2514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013505	TCT	2	6	2593	2598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013505	TAAT	2	8	2641	2648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013505	A	6	6	2649	2654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013505	TTA	2	6	4021	4026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013505	AAT	2	6	4057	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013505	AGT	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013505	GTA	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013505	AGG	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013505	ATT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013505	TAA	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013505	ATT	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013505	AT	3	6	5207	5212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013505	AGG	2	6	5268	5273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013505	TGG	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013505	CTT	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013505	ATA	2	6	5358	5363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013505	CTT	2	6	5414	5419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013505	TA	3	6	5469	5474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013505	GAA	4	12	5492	5503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013505	AAT	2	6	5510	5515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013505	GTA	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013505	AATG	2	8	5555	5562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013505	AAATT	2	10	5577	5586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013505	TTA	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013505	ATT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013505	T	6	6	5625	5630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013505	ATA	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013505	TA	3	6	5730	5735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013505	TTG	2	6	5746	5751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013505	A	6	6	5759	5764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013505	TCT	2	6	5769	5774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013505	TAA	3	9	5783	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013505	TTA	2	6	5799	5804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013505	TAT	2	6	5809	5814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013505	TGT	2	6	5836	5841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013505	T	7	7	5867	5873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013505	ATT	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013505	TA	3	6	5887	5892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013505	ATTT	2	8	5909	5916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013505	TA	3	6	5992	5997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013505	TA	3	6	6041	6046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013505	AT	3	6	6075	6080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013505	TTATAA	2	12	6095	6106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013505	TAC	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013505	GAG	2	6	6155	6160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013505	ATTT	2	8	6179	6186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013505	AAT	2	6	6192	6197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013505	CTA	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013505	CAAC	2	8	6931	6938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013505	GTA	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013505	T	6	6	8517	8522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013505	T	6	6	8525	8530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013505	TTTA	2	8	8535	8542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013505	AAT	2	6	8555	8560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013505	GTA	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013505	TA	3	6	9401	9406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013505	TTC	2	6	9434	9439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013505	ACA	2	6	9452	9457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013505	TTA	2	6	9590	9595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013505	ATA	2	6	9605	9610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013505	AAT	2	6	9612	9617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013505	TAGTA	2	10	9619	9628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013505	ATT	2	6	9637	9642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013505	TAC	2	6	9660	9665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013505	AATC	2	8	9702	9709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013505	ATA	2	6	9714	9719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013505	AGGTA	2	10	9729	9738	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013505	TAAT	2	8	10259	10266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013505	AT	3	6	10272	10277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013505	T	7	7	10310	10316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013505	ATC	2	6	10334	10339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013505	AGA	2	6	10340	10345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013505	TTG	2	6	10366	10371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013505	TAG	2	6	10375	10380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013505	CAT	3	9	10395	10403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013505	TGA	2	6	10404	10409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013505	A	7	7	10425	10431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013505	T	7	7	10955	10961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013505	AAT	2	6	10975	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013505	TCC	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013505	TTA	2	6	11086	11091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013505	TAT	3	9	11181	11189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013505	T	6	6	12873	12878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013505	ATT	2	6	12882	12887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013505	TAGA	2	8	12893	12900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013505	AAT	2	6	12909	12914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013505	CAG	2	6	12923	12928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013505	TAC	2	6	12940	12945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013505	ACA	2	6	12984	12989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013505	ACTTA	2	10	13011	13020	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013505	A	7	7	13073	13079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013505	C	6	6	13081	13086	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_013505	CGC	2	6	13107	13112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013505	CGT	2	6	13126	13131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013505	AAAC	2	8	13194	13201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013505	AGT	2	6	13258	13263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013505	ACT	2	6	13272	13277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013505	TATT	2	8	13285	13292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013505	ATT	2	6	13304	13309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013505	ATTAAA	2	12	13317	13328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013505	TC	3	6	13353	13358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013505	CGC	2	6	13391	13396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013505	AG	3	6	13461	13466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013505	AATC	2	8	13477	13484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013505	TAC	2	6	13522	13527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013505	A	6	6	13561	13566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013505	CCA	2	6	13568	13573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_013505	GTT	2	6	13591	13596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013505	TAAAG	2	10	13691	13700	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013505	GAT	2	6	13701	13706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013505	TC	3	6	13711	13716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013505	T	6	6	13751	13756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013505	CTAA	2	8	13765	13772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013505	TA	3	6	14827	14832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013505	AAT	2	6	14834	14839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013505	CTTT	2	8	14847	14854	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013505	TTA	2	6	14857	14862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013505	TAT	2	6	14896	14901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013505	AAT	2	6	14915	14920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013505	T	6	6	14979	14984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013505	CAAAA	2	10	15041	15050	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_013505	AGT	2	6	15056	15061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013505	AAC	2	6	15069	15074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013505	A	7	7	15075	15081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013505	TAT	2	6	15111	15116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013505	ATT	2	6	15133	15138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013505	ATT	2	6	15174	15179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013505	ATGGCT	2	12	15211	15222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_013505	GAA	2	6	15238	15243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013505	TTGA	2	8	15244	15251	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013505	GAAAA	2	10	15280	15289	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013505	AGA	2	6	15337	15342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013505	AT	3	6	15367	15372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013505	AAC	2	6	15563	15568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_013505	AG	3	6	15570	15575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013505	AGAAA	2	10	15600	15609	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013505	CAA	2	6	15660	15665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_013505	ATT	2	6	15706	15711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013505	TAAG	2	8	15716	15723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013505	AG	3	6	15734	15739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013505	ATC	2	6	15834	15839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_013505	AAGA	2	8	15870	15877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013505	GA	3	6	15903	15908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_013505	AGC	2	6	16056	16061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_013505	TGAT	2	8	16063	16070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013505	TAGA	2	8	16102	16109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013505	CCG	2	6	16127	16132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_013505	GCT	2	6	16189	16194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_013505	ATC	2	6	16204	16209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_013505	GGCAA	2	10	16234	16243	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
185	NC_013505	AGA	2	6	16253	16258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013505	GAG	2	6	16311	16316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013505	GAA	2	6	16362	16367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_013505	A	6	6	16398	16403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013505	TAA	2	6	16509	16514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_013505	AT	4	8	16575	16582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_013505	ATAG	2	8	16611	16618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
193	NC_013505	GC	3	6	16640	16645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
194	NC_013505	TTAC	2	8	16662	16669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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197	NC_013505	GTTAA	2	10	16740	16749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_013505	CA	3	6	16782	16787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
199	NC_013505	TAAA	2	8	16790	16797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_013505	TTA	2	6	16846	16851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_013505	A	6	6	16921	16926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.